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《针对结直肠癌的非侵入性生物标记粪便微生物组的宏基因组分析》

《Metagenomic analysis of faecal microbiome as a tool towards targeted non-invasive biomarkers for colorectal cancer 》

【1】摘要:我们提出了第一个CRC粪便微生物群的宏基因组分析研究,以发现和验证不同种族群体中的微生物标志物,并使用可负担得起的临床相关技术独立验证选定的生物标志物。因此,我们的研究向从粪便样本中获得的可负担得起的非侵入性CRC早期诊断生物标志物又迈进了一步。

【2】研究对象:中国招募了128名患者(74名CRC患者和54名对照组)

【3】入组条件:74名CRC患者(I期15例,II期21例,III期34例,IV期4例;平均年龄67岁;其中女性26人,对照组54人(平均年龄62岁;21岁是女性)。

【4】研究方法:所有三个组群的癌症分期均采用美国癌症联合委员会和国际癌症控制联盟维持的肿瘤、淋巴结、转移分期系统23。粪便样本由个体在家中采集,然后立即在−20℃冷冻。使用Qiagen QIAamp DNA粪便迷你试剂盒(Qiagen)按照厂家说明提取中国样品DNA。对粪便样本进行宏基因组测序,产生了7.51亿的宏基因组阅读量,使用Illumina HiSeq 2000平台

【5】研究结论1:在记录的代谢参数中,空腹血糖升高和高密度脂蛋白降低与CRC状态有显著相关性,与既往报告为危险因素的研究结果一致。

【6】研究结论2:结肠镜检查后收集的CRC患者样本明显多于术前。

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《肝硬化发展为肝癌过程中肠道微生物群的改变》

《Alterations in the Gut Microbiome in the Progression of Cirrhosis to Hepatocellular Carcinoma》

【1】摘要:肝硬化患者肝细胞癌的发展与肠道微生物群的改变有关,包括生物代谢紊乱的加剧和细菌丰富度的降低。本研究表明,随着肝硬化从代偿性肝硬化发展为失代偿性肝硬化,并发展为hcc相关性肝硬化(hcc -肝硬化),细菌丰富度降低和生态失调的程度不断上升。

【2】研究对象:95名个体

【3】入组条件:30名HCC肝硬化患者、38名非HCC肝硬化患者和27名年龄和体重指数(BMI)匹配的健康志愿者

【4】研究方法:收集了粪便样本和饮食频率问卷。进行16S rRNA基因测序

【5】研究结论1:每一阶段的晚期慢性肝病(合并代偿性肝硬化,失代偿性肝硬化,和hc -肝硬化)的特征是粪便微生物种群的特定变化

【6】研究结论2:我们证明肝硬化和hcc -肝硬化与肠道菌群的质的改变有关,包括细菌丰富度的显著降低和细菌组成的改变

【7】研究结论3:未加权的UniFrac比加权的UniFrac更清楚地识别出样本之间的差异模式,这意味着在肝硬化和hc -肝硬化中肠道细菌改变以低丰度特征出现